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Issue
Lait
Volume 84, Number 1-2, January-April 2004
12th Meeting of the " Club des Bactéries Lactiques ".
Page(s) 179 - 189
DOI https://doi.org/10.1051/lait:2003037
Published online 12 December 2003
Lait 84 (2004) 179-189
DOI: 10.1051/lait:2003037

Culture-dependent and culture-independent methods for molecular analysis of the diversity of lactobacilli in "Camembert de Normandie" cheese

Ségolène Henri-Dubernet, Nathalie Desmasures and Micheline Guéguen

Laboratoire de Microbiologie Alimentaire (EA 3213, USC INRA), Université de Caen Basse-Normandie, esplanade de la Paix, 14032 Caen Cedex, France
(Published online 12 December 2003)

Abstract
We compared a culture-dependent and a culture-independent approach for the assessment of lactobacilli community biodiversity and evolution during the production of RDO Camembert in three cheese-making factories. We used temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) to analyse total microbial DNA and DNA from single isolates. TGGE patterns of total microbial DNA from milk and cheese showed that Lactobacillus paracasei subsp. paracasei was a dominant species in the three factories and that Lb. plantarum was also a dominant species in one. TGGE profiles from individual isolates confirmed that these two species were dominant, but also detected Lb. delbrueckii susbp. lactis, Lb. acidophilus, Lb. delbrueckii susbp. bulgaricus and Lb. casei subsp. casei. Thus, the two approaches provided complementary information.

Résumé
Comparaison de méthodes culture-dépendante et culture-indépendante pour l'analyse moléculaire de la diversité des lactobacilles dans le Camembert de Normandie. La contribution de deux approches culture-dépendante et culture-indépendante a été étudiée dans le but d'apprécier la biodiversité et l'évolution des populations de lactobacilles au cours de la transformation de lait cru en camembert AOC dans trois fromageries. Une analyse par électrophorèse en gradient de température (TGGE) a été effectuée comparativement sur l'ADN microbien total et sur l'ADN extrait à partir d'isolats. Les profils TGGE obtenus à partir de l'ADN total de laits et de fromages ont montré que Lactobacillus paracasei subsp. paracasei était une espèce dominante au sein des trois fromageries et que Lb. plantarum co-dominait dans l'un des trois ateliers. Après étude des profils TGGE des isolats, ces deux espèces demeurent majoritaires mais Lactobacillus delbrueckii susbp. lactis, Lb. acidophilus, Lb. delbrueckii susbp. bulgaricus et Lb. casei subsp. casei sont également mis en évidence. Les deux approches ont conduit à l'obtention d'informations complémentaires.


Key words: Lactobacilli / TGGE / Camembert de Normandie cheese / culture-dependent method / culture-independent method

Mots clés : Lactobacille / TGGE / Camembert de Normandie / méthode culture-dépendante / méthode culture-indépendante

Correspondence and reprints: Nathalie Desmasures nathalie.desmasures@ibfa.unicaen.fr

© INRA, EDP Sciences 2004