DOI: 10.1051/lait:2001108

Lait 81 (2001) 13-18

A mini review: proteomic analysis, a post-genomic approach

Jean-François Chich

Unité de Recherche en Biochimie et Structure des Protéines, INRA, Domaine de Vilvert, Bâtiment 526, 78352 Jouy-en-Josas Cedex, France

Abstract
We present here the proteome tool and its current state. Genomics and transcriptomics are briefly described and their limitations are discussed. The various aspects of proteomic approach are then presented and discussed. Proteomics is defined as the expressed complement of a genome. Technical aspects such as two dimensional gel electrophoresis, mass spectrometry and searches in generalist and EST databases changed the protein identification process. Proteomics can be divided into a systematic approach, or cell map proteomic and a pragmatic approach, or study of changes in protein expression.

Résumé
L'analyse protéomique, une approche post-génomique. Nous présentons ici l'outil protéomique et "l'état de l'art ". Génomique et transcriptomique sont brièvement décrites ainsi que leurs limites. Les différents aspects de l'approche protéomique sont ensuite présentés et discutés. La protéomique est définie comme le complément protéique d'un génome. Les aspects techniques comme l'électrophorèse bidimensionnelle, la spectrométrie de masse dans les banques généralistes ou les banques d'EST ont changé le processus d'identification des protéines. La protéomique peut être subdivisée en une approche systématique, ou protéomique de cartographie et une approche pragmatique, ou étude de l'expression des protéines.

Key words: proteomic / database / mass spectrometry

Mots clés : protéomique / banque de données / spectrométrie de masse

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