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Lait
Volume 80, Number 4, July-August 2000
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| Page(s) | 445 - 459 | |
| DOI | https://doi.org/10.1051/lait:2000137 | |
DOI: 10.1051/lait:2000137
Lait 80 (2000) 445-459
Potentiality of Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR) for discrimination and identification of dairy Lactic acid bacteria
Caroline Amiela - Laurence Marieya - Marie-Christine Curk-Daubiéb - Patricia Pichona - Josette Traverta
aLaboratoire de Physico-chimie et Biotechnologies, IUT de Caen, Université de Caen Basse
Normandie, 14032 Caen cedex, France
bADRIA Normandie, boulevard du 13 juin 1944, BP 2, 14310 Villers Bocage, France
(
Abstract:
The potentiality of FTIR spectroscopy for the identification of lactic acid bacteria (LAB) used in the
dairy industry was tested. For this purpose, spectra of different strains were recorded using standardized
conditions. These strains were species of Lactobacillus (12 species, 3 subspecies), Lactococcus (4 species, 3 subspecies), Leuconostoc (3 species, 3 subspecies), Weissella (1
species) and Streptococcus (2 species) involved in the soft cheese industry. Spectral libraries were
then established by statistical analysis. Reference strains were then tested on these libraries, and 100%
of correct identifications were obtained at the genus and species level, 86% at the subspecies level.
Well-identified strains were included in libraries. Wild isolates (n=48) previously identified by
biochemical tests and RAPD method were then tested. We obtained 100% at the genus level and 69% at the
species level of correlation between FTIR and other methods. Finally, spectra of reference strains
performed in other laboratories were tested with the same method, and the results tallied with official
identification in 100% of the cases at the genus level and in 41% of the cases at the species level.
These results concerning a few strains allow us to plan the development of a more complete database for
rapid identification of LAB.
Keywords:
FTIR spectroscopy / lactic acid bacteria / classification / identification
Résumé:
Potentialités de la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF) pour la discrimination
et l'identification de bactéries lactiques d'intérêt laitier. La discrimination et l'identification de
souches de bactéries lactiques d'origine laitière ont été étudiées par spectroscopie IRTF. Les spectres de
28 souches de bactéries lactiques appartenant aux genres Lactobacillus (12 espèces, 3 sous-espèces),
Lactococcus (4 espèces, 3 sous-espèces), Leuconostoc (3 espèces, 3 sous-espèces),
Weissella (1 espèce) et Streptococcus (2 espèces) ont été enregistrés dans des conditions
standardisées. Ces spectres ont permis d'établir des bibliothèques spectrales de référence auxquelles ont
été comparés de nouveaux spectres de souches de collection et de souches sauvages. L'identification des
souches de collection (5 espèces, 7 sous-espèces) a été correcte dans 100 % des cas au niveau genre et
espèce, et 86 % au niveau sous-espèce. Les souches correctement identifiées ont été introduites dans les
bibliothèques. L'identification IRTF de 48 isolats a été corrélée à 100 % au niveau genre et à 69 % au
niveau espèce avec les identifications biochimiques et les résultats de la RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA) préalablement obtenus. Enfin, les spectres de 17 souches de collection enregistrés par
d'autres équipes ont été testés sur nos bases de données. Leur identification a été correcte dans 100 %
des cas au niveau genre et 41 % des cas au niveau espèce. La spectroscopie IRTF s'est donc avérée une
méthode efficace pour la discrimination et l'identification des espèces étudiées. Les résultats obtenus
nous permettent d'envisager le développement d'une base de données plus complète pour l'identification des
bactéries lactiques.
Mots clé :
spectroscopie IRTF / bactérie lactique / identification / discrimination
Correspondence and reprints: Laurence Mariey
Tel.: (33) 2 31 56 71 19; fax: (33) 2 31 56 71 65; e-mail: l.mariey@iutcaen.unicaen.fr
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