Lait 78 (1998) 203-216
DOI: 10.1051/lait:1998223

Rapid identification of dairy Propionibacterium species by restriction analysis of the insertion within the 23S rRNA gene

D. Fessler^a, D. Fessler^b, M.G. Casey^a and Z. Puhan<sup>b

a</sup>  Federal Dairy Research Instituts, 3003 Bern, Switzerland
^b  Laboratory of Dairy Science, Swiss Federal Institute of Technology, Zurich, Switzerland

(Received 17 February 1997; accepted 3 June 1997)

Abstract - An amplified sequence of approximately 350 bases from the 23S rRNA gene of each bacteria was used to identify 37 strains of dairy propionibacteria. After generation of the fragment by PCR (polymerase chain reaction), it was cut with the restriction endonuclease MspI. The resulting electrophoretic pattern showed a distinct profile for each of the Propionibacterium species. Purification of DNA was not necessary and the analyses could also be performed with crude bacterial extract. A collection of anaerobic bacteria commonly found in milk and milk products was also submitted to the analysis. None yielded the same pattern as propionibacteria. The analysis of the propionibacteria was compared to that performed by electrophoresis of the soluble cell-free protein extracts and that of classical microbiological tests. Our method gave identical results and was less time consuming (results could be obtained within a single day and were also easier to read) than both the classical tests and protein electrophoresis. © Inra / Elsevier, Paris.

Résumé - Identification rapide des espèces de bactéries propioniques laitières par analyse de restriction de l'insertion dans le gène de l'ARNr 23S
Une séquence amplifiée d'environ 350 bases du gène de l'ARNr 23S de chaque bactérie a été utilisée pour l'identification de 37 souches de bactéries propioniques laitières. Le fragment a été amplifié par PCR (polymerase chain reaction), puis coupé par l'enzyme de restriction Mspl. Le profil électrophorétique obtenu a été différent pour chaque espèce de bactérie propionique. Les analyses ont aussi été réalisées avec des extraits bruts de bactéries, sans purification préalable de l'ADN. Toute une série de bactéries anaérobies habituellement présentes dans le lait a également été soumise à cette analyse, sans que les profils obtenus aient correspondu à ceux des bactéries propioniques. Cette technique d"analyse a été comparée à celle de l'électrophorèse des extraits solubles des protéines et à celle des tests classiques de la microbiologie. Nos résultats étaient identiques à ceux des deux autres méthodes, mais ils ont été obtenus plus rapidement (en un seul jour) et sont de lecture plus facile. © Inra / Elsevier. Paris.

Key words: Propionibacterium / identification / PCR / restriction analysis / 23S rRNA

Mots clés : Propionibacterium / identification / PCR / analyse de restriction / ARNr 23S