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DOI: 10.1051/lait:2000146
Lait 80 (2000) 589-600
Protein fingerprinting as a complementary analysis to classical phenotyping for the identification of lactic acid bacteria from Tenerife cheese
Graciela Pérez - Evaristo Cardell - Victoria Zárate
Departamento de Microbiología y Biología Celular, Universidad de La Laguna,
La Laguna 38206, Tenerife, Spain
(
Abstract:
A total of 125 lactic acid bacteria (LAB) from the genera Lactococcus,
Lactobacillus and Leuconostoc isolated from Tenerife cheese were identified by
both classical phenotypic and protein fingerprinting methods. Classical
identification revealed the presence of 11 different species and subspecies of
LAB. Lactobacilli and leuconostocs identification was easy to achieve with the
API 50 CH system. By contrast, the identification of lactococci was difficult due
to the heterogeneous and atypical profiles displayed by our strains. Sodium dodecyl
sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) of cell-free extracts
(protein fingerprinting) has proved to be an efficient identification method for
LAB from Tenerife cheese. It generated complex and stable patterns that are easy
to interpret and compare with those of the reference strains. SDS-PAGE analysis
could discriminate well between the 8 different species and subspecies of LAB.
However, the assignment of LAB strains to one of the Leuconostoc mesenteroides
subspecies required, in addition to protein fingerprinting, the performance of two
biochemical tests. When results of both identification methods were compared, 23%
of Tenerife cheese LAB isolates turned out to have been misclassified by the
classical technique.
Keywords:
lactic acid bacteria / cheese / identification / protein fingerprinting
Résumé:
L'empreinte digitale des protéines comme analyse complémentaire aux méthodes phénotypiques
classiques pour l'identification des bactéries lactiques du fromage de Tenerife.
Cent-vingt-cinq bactéries lactiques (LAB) des genres Lactococcus, Lactobacillus et
Leuconostoc, isolées à partir du fromage de Tenerife, ont été identifiées par les
méthodes phénotypiques classiques et par la méthode d'empreinte digitale des protéines.
Par identification classique, 11 espèces et sous-espèces différentes des LAB ont été
mises en évidence. Les lactobacilles et leuconostocs ont été facilement identifiés à
l'aide du système API 50 CH. Par contre, l'identification des lactocoques s'est révélée
difficile en raison des profils hétérogènes et atypiques des souches. L'électrophorèse
en SDS polyacrylamide (SDS-PAGE) de l'extrait cellulaire (l'empreinte digitale des
protéines) s'est montrée efficace pour l'identification des LAB du fromage de
Tenerife, car elle a conduit à des profils complexes et stables faciles à interpréter
et à comparer à ceux des souches de référence. L'analyse par SDS-PAGE a permis de
distinguer clairement 8 espèces et sous-espèces différentes de LAB. Cependant,
l'identification des sous-espèces de Leuconostoc mesenteroides a nécessité la
réalisation de 2 tests biochimiques complémentaires. Quand on compare les deux
méthodes d'identification, on constate que 23 % des LAB isolées du fromage de
Tenerife sont incorrectement identifiées par la technique classique.
Mots clé :
bactérie lactique / fromage / identification / empreinte digitale des protéines
Correspondence and reprints: Victoria Zárate
Tel.: (34) 922 318515;
fax: (34) 922 630095; e-mail: vzarate@ull.es
Copyright INRA, EDP Sciences
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