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Issue
Lait
Volume 80, Number 6, November-December 2000
Page(s) 589 - 600
DOI http://dx.doi.org/10.1051/lait:2000146
DOI: 10.1051/lait:2000146

Lait 80 (2000) 589-600

Protein fingerprinting as a complementary analysis to classical phenotyping for the identification of lactic acid bacteria from Tenerife cheese

Graciela Pérez - Evaristo Cardell - Victoria Zárate

Departamento de Microbiología y Biología Celular, Universidad de La Laguna, La Laguna 38206, Tenerife, Spain

(Received 21 February 2000; accepted 5 June 2000)

Abstract:

A total of 125 lactic acid bacteria (LAB) from the genera Lactococcus, Lactobacillus and Leuconostoc isolated from Tenerife cheese were identified by both classical phenotypic and protein fingerprinting methods. Classical identification revealed the presence of 11 different species and subspecies of LAB. Lactobacilli and leuconostocs identification was easy to achieve with the API 50 CH system. By contrast, the identification of lactococci was difficult due to the heterogeneous and atypical profiles displayed by our strains. Sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) of cell-free extracts (protein fingerprinting) has proved to be an efficient identification method for LAB from Tenerife cheese. It generated complex and stable patterns that are easy to interpret and compare with those of the reference strains. SDS-PAGE analysis could discriminate well between the 8 different species and subspecies of LAB. However, the assignment of LAB strains to one of the Leuconostoc mesenteroides subspecies required, in addition to protein fingerprinting, the performance of two biochemical tests. When results of both identification methods were compared, 23% of Tenerife cheese LAB isolates turned out to have been misclassified by the classical technique.


Keywords: lactic acid bacteria / cheese / identification / protein fingerprinting

Résumé:

L'empreinte digitale des protéines comme analyse complémentaire aux méthodes phénotypiques classiques pour l'identification des bactéries lactiques du fromage de Tenerife. Cent-vingt-cinq bactéries lactiques (LAB) des genres Lactococcus, Lactobacillus et Leuconostoc, isolées à partir du fromage de Tenerife, ont été identifiées par les méthodes phénotypiques classiques et par la méthode d'empreinte digitale des protéines. Par identification classique, 11 espèces et sous-espèces différentes des LAB ont été mises en évidence. Les lactobacilles et leuconostocs ont été facilement identifiés à l'aide du système API 50 CH. Par contre, l'identification des lactocoques s'est révélée difficile en raison des profils hétérogènes et atypiques des souches. L'électrophorèse en SDS polyacrylamide (SDS-PAGE) de l'extrait cellulaire (l'empreinte digitale des protéines) s'est montrée efficace pour l'identification des LAB du fromage de Tenerife, car elle a conduit à des profils complexes et stables faciles à interpréter et à comparer à ceux des souches de référence. L'analyse par SDS-PAGE a permis de distinguer clairement 8 espèces et sous-espèces différentes de LAB. Cependant, l'identification des sous-espèces de Leuconostoc mesenteroides a nécessité la réalisation de 2 tests biochimiques complémentaires. Quand on compare les deux méthodes d'identification, on constate que 23 % des LAB isolées du fromage de Tenerife sont incorrectement identifiées par la technique classique.


Mots clé : bactérie lactique / fromage / identification / empreinte digitale des protéines

Correspondence and reprints: Victoria Zárate
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